تاریخ استونی به هزارهها باز میگردد. نخستین نشانههای فعالیت انسانی در منطقه کشور به پایان دوره سنگی، حدود 8500 سال قبل از میلاد مسیح تعلق دارد. اینها شکارچیان و گردآورندگان بودند که پس از خود آثار بسیاری از پیداهای باستانشناسی به جا گذاشتند.
در طول هزارههای بعدی، فرهنگهای مختلفی نظیر فرهنگ مزولیتیک، نئولیتیک و برنز در قلمرو استونی توسعه یافتند. در آغاز عصر ما، قبایل مختلف فینو-اوگری در منطقه سکونت داشتند.
از آغاز قرن سیزدهم، استونی به هدفی برای قدرتهای همسایه تبدیل شد. در سال 1208، نخستین لشکرکشی صلیبی آغاز شد که منجر به تأسیس کلیسای پایتخت تالین و آغاز مسیحیت در منطقه گردید.
تا اواسط قرن سیزدهم، استونی میانOrder Livonian و دانمارکیها تقسیم شد. در این زمان، ساخت قلعهها و دژهایی مانند قلعه توراید و Rathaus تالین آغاز گردید.
در قرن شانزدهم، استونی به عرصهای برای نبرد میان کشورهای مختلف، از جمله سوئد و لهستان تبدیل شد. در سال 1561، بخش بزرگی از استونی تحت کنترل سوئد قرار گرفت. این دوره با اصلاحات و توسعه قابل توجه فرهنگ و آموزش همراه بود.
در قرن هفدهم، استونی به یک مرکز تجاری و فرهنگی مهم در بالتیک تبدیل شد که به توسعه اقتصادی آن کمک کرد.
در سال 1710، پس از جنگ شمالی، استونی به روسیه الحاق شد. در این دوره تغییرات قابل توجهی در ساختار اجتماعی و سیاسی رخ داد. قدرت به زمینداران منتقل شد و دهقانان به آنها وابسته شدند.
اما در پایان قرن نوزدهم، فرایند بیداری ملی آغاز شد. استونیاییها به هویت خود پی بردند و به دنبال خودمختاری فرهنگی بودند.
پس از جنگ جهانی اول، استونی در 24 فوریه 1918 استقلال خود را اعلام کرد. این نتیجه تلاشهای جنبشهای ملی بود که به دنبال تأسیس یک دولت مستقل بودند.
با این حال، استقلال موقت بود. در سال 1940، استونی به اتحاد جماهیر شوروی ملحق شد و سپس در سال 1941 تحت اشغال نازیهای آلمان قرار گرفت. در سال 1944، استونی دوباره بخشی از اتحاد جماهیر شوروی شد.
در سال 1991، پس از فروپاشی اتحاد جماهیر شوروی، استونی دوباره استقلال خود را به دست آورد. این دوره با اصلاحات اقتصادی و سیاسی قابل توجه همراه بود.
استونی به عضویت اتحادیه اروپا و ناتو درآمد که به ادغام آن در جامعه بینالمللی کمک کرد.
امروزه استونی به عنوان یکی از پیشرفتهترین کشورهای در زمینه فنآوریهای دیجیتال شناخته میشود و دارای اقتصادی پیشرفته و سطح بالای زندگی است.