Estonya'nın devlet sistemi, antik dönemlerden başlayarak uluslararası arenada tanınan modern bir devlete kadar uzun ve karmaşık bir evrim süreci geçirmiştir. Estonya, bağımsızlık, yabancı yönetim, işgal ve egemenliğin yeniden kazanılması dönemleri de dahil olmak üzere birçok politik değişiklik yaşamıştır. Bu küçük ama bağımsız ulusun tarihi, demokratik kurumların gelişimindeki önemli aşamaları ve dış tehditler ve değişimler altında yönetim özelliklerini yansıtır.
Estonya'nın topraklarında Hristiyanlıktan önce çeşitli kabileler, yerel birlikler şeklinde "devlet oluşumları" oluşturmuşlardı. Bu topluluklar, kabile ve aşiret dayanışması ilkesine dayanıyordu ve basit yasalar ve gelenekler üzerine kurulmuştu. Ancak bu kabilelerin merkezi bir yönetimi yoktu ve liderleri genellikle yalnızca kendi bölgelerindeki yönetimle ilgileniyordu.
VIII-XI. yüzyıllar arasında Estonya, İskandinavlar ve Alman şövalyeleri gibi komşu halklar tarafından dış kontrol ve akınlar dönemine tanıklık etti. Bu dönemde, kabile yapıdan daha organize sosyal yapılara geçiş süreci gerçekleşti ve bu durum devlet sisteminin devam eden evrimini etkiledi.
XIII. yüzyılda Estonya topraklarına Almanya'nın etkisi geldi ve bu durum bölgenin siyasi haritasını köklü bir şekilde değiştirdi. 1227 yılında, başarılı haçlı seferlerinin ardından, Estonya'nın günümüzdeki toprakları olan Estonya Dükalığı, bu toprakları birkaç yüzyıl boyunca yöneten Tatar Şövalyeleri tarafından ele geçirildi. Bu devlet yapısı sıkı bir şekilde merkeziydi ve Katolik kilisesinin otoritesine dayanıyordu, böylece dış ve iç birliği sağlanıyordu. Alman feodal lordları ana yöneticilerdi ve yerel Estonyalılar onların kontrolü altındaydılar.
Tatar Şövalyelerinin yönetimi altında, Estonya XVI. yüzyıla kadar kalmıştır. Livonya Savaşı sonucunda, toprak Rusya, İsveç ve Polonya arasında bölündü. İsveç ve Rus işgali, bölgedeki siyasi sistemin evrimi üzerinde önemli bir etkide bulunarak yeni idari birimlerin oluşturulmasına ve yeni yasaların uygulanmasına yol açtı.
XVII. yüzyılda Estonya'nın bir kısmı İsveç'in kontrolü altına girdiğinde, bölgede devlet yapısını güçlendirmeye yönelik birkaç reform gerçekleştirildi. İsveç, yönetimde daha merkezi bir sistem getirdi, idari birimler oluşturarak yerel temsilcileri hükümete yönlendirdi. İsveç reformları, Estonya'nın hukuk sisteminin ve ekonomisinin gelişiminde önemli oldu; çünkü okul ağı genişletildi ve ticaret gelişmeye başladı.
Ancak XVIII. yüzyılın başlarında, Kuzey Savaşı sonucunda Estonya Rus İmparatorluğu'na geçti. 1710 yılından itibaren Rus işgali sırasında yeni idari sistemler uygulandı, hukuki yapı değiştirildi ve Rus valilerinin rolü güçlendirildi. Rus İmparatorluğu döneminde Estonya, Baltık eyaletinin parçasıydı ve bölgenin siyasi ve ekonomik gelişimi St. Petersburg'un politikası ile yakından ilişkiliydi. Rus yönetimi altında Estonya tam bir siyasi bağımsızlık sahibi değildi, ancak yavaş yavaş daha geniş bir imparatorluk sisteminin parçası haline gelerek devlet yapısının evrimini etkiledi.
XX. yüzyılın başlarında, 1905 devriminin ardından, Estonya'da ulusal bilinç ve bağımsızlık arzusu aktif bir şekilde gelişmeye başladı. Birinci Dünya Savaşı ve Rusya'daki Şubat Devrimi olayları, Estonya'nın 24 Şubat 1918'de bağımsızlık ilan etmesi için bir katalizör oldu. Bu, iç krizler yaşayan ulusların kendi kaderini tayin etme isteğinin yeni bağımsız devletlerin oluşumuna etki ettiği bir dönemdi, bu devletlerden biri de Estonya'ydı.
Estonya Cumhuriyeti, siyasi istikrarsızlık koşullarında ilan edildi, o sırada Rusya bir devrim ve iç savaş yaşıyordu. Estonya, 1918 ile 1920 yılları arasında Sovyet Rusya ile bağımsızlık savaşı yürüttü. Bu savaş sonucunda Estonya, 1920'de Sovyet Rusya ile Tartu Barış Antlaşması'nı imzalayarak bağımsızlığını pekiştirdi. Bu dönemde, Estonya Cumhuriyeti'nin ilk Anayasası geliştirildi ve bu anayasa devletin temellerini, demokratik yönetim biçimi ve parlamenter sistemi belirledi.
1920'li yıllardan itibaren Estonya, demokratik bir devlet olarak gelişmeye devam etti, ancak ekonomik istikrarsızlık ve siyasi krizler gibi iç ve dış zorluklar, 1934 yılında Konstantin Päts yönetiminde otoriter bir darbenin gerçekleştirilmesine yol açtı. Bu dönem, başkanın sert otoritesinin tesis edilmesi ve parlamenter sistemin kaldırılması ile belirginleşti.
1937 yılında yeni bir Anayasa kabul edildi, bu anayasayla başkanın yetkileri güçlendirildi ve politik yaşamda merkezi bir rol oynaması sağlandı. Ancak bu dönem uzun sürmedi, çünkü 1940 yılında İkinci Dünya Savaşı ve Sovyet genişlemesi sırasında Estonya, Sovyetler Birliği tarafından işgal edildi ve bu durum ülkenin bağımsızlık dönemini uzun yıllar sona erdirdi.
İkinci Dünya Savaşı sonrasında Estonya, Sovyetler Birliği'nin birer yan kuruluşu oldu. Sovyet yönetimi boyunca Estonya'nın devlet sistemi Moskova'daki merkezi otoriteye tabi hale geldi. Bu durum, politik özgürlüklerin kısıtlanmasını, zorla toplulaştırmayı ve bağımsız siyasi yaşamın sona ermesini beraberinde getirdi.
Keskin Sovyet politikasına rağmen, Estonya'da sanat, eğitim ve dil gibi alanlarda kendini gösteren eşsiz bir kültürel kimlik korunuyordu. 1980'lerde Sovyetler Birliği'ndeki politika değişiklikleri sırasında, ulusal bilincin yeniden canlanması süreci başladı ve bu süreç Estonya'nın bağımsızlığının yeniden kazanılmasına yol açtı.
24 Ağustos 1991'de, Sovyetler Birliği'nin çöküşü sırasında, Estonya tekrar bağımsızlığını ilan etti. Bağımsızlığın yeniden kazanılması süreci nispeten barışçıl geçti, ancak aynı zamanda etnik ve dil sorunlarıyla ilgili politik ve sosyal gerginlikler ve ekonomik zorluklarla da birlikte yaşandı. Estonya, ayrıca yeni bir parlamento, yargı sistemi ve yürütme makamları oluşturarak tüm devlet sistemini reforme etme ihtiyacıyla karşı karşıya kaldı.
Bağımsızlığın yeniden kazanılmasından sonra Estonya, demokratik reformlar ve uluslararası kuruluşlarla entegrasyona aktif bir şekilde yöneldi. 2004 yılında Estonya, Avrupa Birliği ve NATO'ya katıldı ve bu durum Batı siyasi ve ekonomik sistemine entegrasyonunu simgeliyordu. Modern Estonya, yüksek gelişmişlikte demokratik bir devlet olup, bilgi teknolojileri ve sosyal reformları aktif bir şekilde geliştirerek istikrarlı ve refah dolu bir devlet sistemini güçlendirmeye doğru yol almıştır.