Malaysia'nın tarihi 7000 yılı aşkın bir süreyi kapsamaktadır ve çeşitli kültürler, dinler ve siyasi sistemleri içermektedir. Güneydoğu Asya'da bulunan bu ülke, yüzyıllar boyunca ticaret yolları ve kültürel etkileşimlerin kesişim noktası olmuştur.
Malaysia topraklarının ilk yerleşimi M.Ö. yaklaşık 4000 yılında başlamıştır. Gua Chan tayı mağarasındaki buluntular gibi arkeolojik kalıntılar, avcı-toplayıcıların varlığını göstermektedir. M.Ö. 300 civarında demir çağına gelindiğinde, yarımadada tarım ve ticaretle uğraşan daha karmaşık toplumlar gelişmeye başladı.
M.S. başlarında Malaysia, Hindistan ve Çin arasındaki geniş ticaret ağına katıldı. Hintli tüccarlar, sadece ürünleri değil, aynı zamanda Budizm ve Hinduizm gibi dinleri de beraberinde getirdiler. Bu dinler, kültür ve toplumu üzerinde önemli bir etki yarattı. Bu dönemde Kedah ve Srivijaya gibi ilk devletler ortaya çıkarak önemli ticaret merkezleri haline geldi.
XIII. yüzyılda İslam Malaysia'da yayılmaya başladı, özellikle Arap ülkeleriyle ticaret aracılığıyla. İslam, Arap ve Hindistanlı tüccarlar ile misyonerler tarafından getirildi. XV. yüzyıla gelindiğinde İslam, bölgede baskın din haline gelmiş, bu da Melaka gibi birçok sultanlığın kurulmasına yol açmıştır; Melaka, Güneydoğu Asya'nın en güçlü sultanlıklarından biri haline gelmiştir.
XVI. yüzyılda, Avrupa sömürgecilerinin gelişiyle Malaysia'nın tarihi yeni bir yön aldı. Portekizliler 1511'de Malaka'yı ele geçirdi, ardından 1641'de Hollandalılara geçti. İngiltere, 1786'da Penang'ı ele geçirerek ve Kedah sultanı ile bir antlaşma imzalayarak bölgede varlık göstermeye başladı.
XIX. yüzyıla gelindiğinde, İngiltere Malaysia'nın büyük bir kısmı üzerinde protektora sistemi ile kontrol sağlamıştı. Bu durum, ekonomide önemli değişikliklere yol açtı; tarım plantasyonlarının gelişimi, Çin ve Hindistan'dan birçok göçmeni çekerek çok kültürlü bir toplum oluşturdu.
İkinci Dünya Savaşı sonrasında, Japonya Malaysia'yı işgal ettiğinde, yerel halk bağımsızlık gereksinimini fark etmeye başladı. 1946'da birkaç Malay devletini birleştiren Malay Federasyonu kuruldu. Ancak yerel bağımsızlık hareketleri güçlenmeye başladı ve 1957'de Malaysia, İngiltere'den bağımsızlığını kazandı.
1963 yılında Malaysia, Singapur, Sabah ve Saravak ile bir federasyon oluşturdu, ancak Singapur 1965'te birlikten ayrıldı. Bu birleşim süreci karmaşıktı ve etnik çatışmalar ile birlikteydi, ancak nihayetinde tek bir ulusun kurulmasına yol açtı.
Bağımsızlıktan bu yana, Malaysia önemli bir ekonomik büyüme ve siyasi istikrar elde etti. Ülke, ekonomik eşitsizliği azaltmayı ve halkın yaşam kalitesini iyileştirmeyi amaçlayan "Malaysia 2020" ve "Yeni Ekonomik Politika" gibi programların uygulanması dahil birçok ekonomik reform ve modernizasyon sürecinden geçmiştir.
21. yüzyılın başlarında, Malaysia çok etnikli bir toplum olarak gelişmeye devam etti ve ırksal ve dini farklılıklarla ilgili zorluklarla karşılaştı. 2018 yılında, 1957'den beri ilk kez iktidara gelen koalisyon, yolsuzlukla mücadele ve demokratik süreçleri iyileştirmeyi amaçlayan reformlar yürüttü.
Malaysia'nın tarihi, farklı kültürlerin ve dinlerin etkisi altında şekillenen çok kültürlü bir toplumun hikayesidir. Bugün Malaysia, benzersiz mirasını korurken modern başarılar ve küresel etkileşime yönelik çabalar göstermektedir.