पानामा की उपनिवेशीय अवधि XVI सदी की शुरुआत में शुरू हुई, जब स्पेनिश conquistadors पहली बार उस क्षेत्र में आए, जिसे आज पानामा के नाम से जाना जाता है। यह अवधि तीन सौ वर्षों से अधिक चली और इस दौरान महत्वपूर्ण सामाजिक, आर्थिक और सांस्कृतिक परिवर्तनों का अनुभव हुआ।
1501 में स्पेनिश अन्वेषक एलोंसो डे ओहेदा पानामा की धरती पर कदम रखने वाले पहले यूरोपीय बने। 1513 में वास्को नुñez दे बाल्बोआ पहले व्यक्ति बने जिन्होंने प्रशांत महासागर को देखा, जिसने इस क्षेत्र में स्पेन की रुचि को काफी बढ़ा दिया। उन्होंने पानामा के क्षेत्र में पहला स्पेनिश बस्ती स्थापित किया — दराज़ा, जो आगे की उपनिवेशीकरण के लिए एक प्रारंभिक बिंदु बन गया।
पानामा तेजी से स्पेनिश उपनिवेशी साम्राज्य के लिए एक महत्वपूर्ण व्यापारिक केंद्र में बदल गई। देश का रणनीतिक स्थान अटलांटिक और प्रशांत महासागरों के बीच व्यापार और माल परिवहन के विकास के लिए सहायक रहा। स्पेनिशों ने अन्य उपनिवेशों, जैसे पेरू, से निकाले गए सोने और चांदी के लिए पानामा को एक ट्रांजिट बिंदु के रूप में उपयोग किया।
अपने व्यापारिक मार्गों की सुरक्षा सुनिश्चित करने के लिए, स्पैनिशों ने किलों और उपनिवेशों का निर्माण किया। अटलांटिक पक्ष पर मुख्य बंदरगाह पानामा-सिटी बना, जिसे 1519 में स्थापित किया गया, और जो जल्द ही एक महत्वपूर्ण आर्थिक और प्रशासनिक केंद्र बन गया।
उपनिवेशीकरण ने क्षेत्र की सामाजिक संरचना में महत्वपूर्ण परिवर्तन लाए। स्पेनिशों ने प्लांटेशनों पर काम करने के लिए अफ्रीका से दासों को लाया, जिसने पानामा की जनसांख्यिकीय संरचना को बदल दिया। स्थानीय इंडियन जनजातियों, जैसे केचुआ और एम्बेरा, को कठोर दमन का सामना करना पड़ा, और उनकी संस्कृति और जीवनशैली भी प्रभावित हुई।
यूरोपीय लोगों, अफ्रीकी दासों और स्थानीय निवासियों के सह-अस्तित्व ने एक नई संस्कृति का निर्माण किया, जो बाद में पानामाई पहचान का आधार बन गई।
स्पैनिशों ने कैथोलिकिज़्म को लाया, जो क्षेत्र में प्रमुख धर्म बन गया। मिशनरियों ने मूल जनसंख्या के बीच सक्रिय रूप से काम किया, उन्हें ईसाई धर्म में परिवर्तित करने का प्रयास किया। चर्च और कैथोलिक संस्थाएं बनाई गईं, जो उपनिवेशीय समाज की सामाजिक संरचना का महत्वपूर्ण हिस्सा बन गईं।
धर्म ने क्षेत्र के सांस्कृतिक जीवन में भी महत्वपूर्ण भूमिका निभाई, कला, वास्तुकला और जनसंख्या की रीति-रिवाजों पर प्रभाव डालते हुए।
पानामा न्यू ग्रेनाडा के वाइस-रॉयल्टी का हिस्सा थी, जिसे 1717 में स्थापित किया गया था, और इसे स्पेनिश गवर्नरों द्वारा संचालित किया गया। इस संदर्भ में, स्थानीय अधिकारियों और स्पेनिश उपनिवेशीय प्रशासकों के बीच सत्ता की लड़ाई चल रही थी, जो कभी-कभी संघर्ष का कारण बन जाती थी।
स्थानीय कुलीनता धीरे-धीरे शक्ति और प्रभाव धारण करने लगी, जो भविष्य के स्वतंत्रता आंदोलनों का आधार बनी।
उपनिवेशीय अवधि के दौरान पानामा में विभिन्न विद्रोह और संघर्ष हुए, जो आंतरिक और बाहरी दोनों कारकों से संबंधित थे। इनमें से एक ज्ञात विद्रोह 1739 का था, जो स्पेनिश सत्ता के खिलाफ था, जिसे आर्थिक कठिनाइयों और स्थानीय जनसंख्या की मांगों से प्रेरित किया गया था।
इसके अलावा, स्पेन इंग्लैंड और फ्रांस जैसी अन्य यूरोपीय शक्तियों के प्रति खतरे का सामना कर रहा था, जो पानामा के उपनिवेशीय प्रशासन पर भी प्रभाव डालता था।
XVIII और XIX सदी की शुरुआत में लैटिन अमेरिका में स्वतंत्रता आंदोलनों की शुरुआत हुई। पानामा इसका अपवाद नहीं था, और स्थानीय लोगों ने स्पेन के साम्राज्य से अधिक स्वायत्तता और स्वतंत्रता की मांग की। इस प्रक्रिया को स्पेन की स्वतंत्रता की युद्ध जैसे घटनाओं ने तेज किया, जो 1800 के दशक की शुरुआत में हुईं।
1821 में पानामा ने अंततः स्पेन से अपनी स्वतंत्रता की घोषणा की और महान कोलंबिया में शामिल हो गई, जो इसके इतिहास में एक नए चरण की शुरुआत बनी।
पानामा की उपनिवेशीय अवधि ऐसे महत्वपूर्ण परिवर्तनों का समय था, जिन्होंने इसके सांस्कृतिक और सामाजिक विरासत को आकार दिया। स्पेनिश उपनिवेश का प्रभाव आज भी महसूस होता है, लेकिन यह पानामाई पहचान की स्वतंत्रता और विकास के आगे के प्रयासों का भी आधार बना।