Il periodo coloniale di Panama iniziò all'inizio del XVI secolo, quando i conquistatori spagnoli arrivarono per la prima volta nel territorio che oggi conosciamo come Panama. Questo periodo durò oltre trecento anni ed è stato caratterizzato da significativi cambiamenti sociali, economici e culturali.
Nel 1501 l'esploratore spagnolo Alonso de Ojeda divenne il primo europeo a mettere piede nella terra di Panama. Nel 1513 Vasco Núñez de Balboa fu il primo uomo a vedere l'oceano Pacifico, il che aumentò notevolmente l'interesse della Spagna per questa regione. Fondò il primo insediamento spagnolo sul territorio di Panama — Darien, che divenne il punto di partenza per ulteriori colonizzazioni.
Panama si trasformò rapidamente in un importante nodo commerciale per l'impero coloniale spagnolo. La posizione strategica del paese tra gli oceani Atlantico e Pacifico favorì lo sviluppo del commercio e del trasporto di merci. Gli spagnoli utilizzarono Panama come punto di smistamento per l'oro e l'argento estratti in altre colonie, come il Perù.
Per garantire la sicurezza delle loro rotte commerciali, gli spagnoli costruirono fortezze e colonie. Il principale porto sul lato atlantico divenne Panama City, fondata nel 1519, che presto divenne un importante centro economico e amministrativo.
La colonizzazione portò a significative modifiche nella struttura sociale della regione. Gli spagnoli portarono schiavi dall'Africa per lavorare nelle piantagioni, cambiando il panorama demografico di Panama. Le popolazioni indigene locali, come Quechua e Embera, subirono repressioni brutali, e la loro cultura e modo di vivere furono gravemente danneggiati.
La coesistenza di europei, schiavi africani e abitanti locali portò alla formazione di una nuova cultura che in seguito divenne la base dell'identità panamense.
Gli spagnoli portarono il cattolicesimo, che divenne la religione dominante nella regione. I missionari lavorarono attivamente tra la popolazione indigena, cercando di convertirla al cristianesimo. Furono costruite chiese e istituzioni cattoliche, che divennero parti importanti della struttura sociale della società coloniale.
La religione giocò anche un ruolo fondamentale nella vita culturale della regione, influenzando l'arte, l'architettura e le usanze popolari.
Panama faceva parte del Vice-regno della Nuova Granada, creato nel 1717, e era governata da governatori spagnoli. In questo contesto, si verificava una lotta per il potere tra le autorità locali e gli amministratori coloniali spagnoli, che a volte portava a conflitti.
Le élite locali iniziarono gradualmente ad accumulare potere e influenza, gettando le basi per futuri movimenti di indipendenza.
Nel periodo coloniale a Panama si verificarono vari ribellioni e conflitti, legati sia a fattori interni che esterni. Una delle ribellioni più famose fu quella del 1739 contro il potere spagnolo, causata da difficoltà economiche e richieste della popolazione locale.
Inoltre, la Spagna affrontava minacce da parte di altre potenze europee, come Inghilterra e Francia, il che influenzava anche l'amministrazione coloniale di Panama.
Verso la fine del XVIII e l'inizio del XIX secolo, cominciarono a emergere movimenti di indipendenza in America Latina. Panama non fece eccezione, e gli abitanti locali iniziarono a chiedere maggiore autonomia e indipendenza dalla corona spagnola. Questo processo fu accelerato da eventi come la guerra di indipendenza spagnola all'inizio dell'800.
Nel 1821 Panama dichiarò finalmente la sua indipendenza dalla Spagna e si unì alla Gran Colombia, un nuovo capitolo nella sua storia.
Il periodo coloniale di Panama fu un'epoca di significativi cambiamenti che plasmarono il suo patrimonio culturale e sociale. L'influenza della colonizzazione spagnola è avvertita ancora oggi, ma è anche divenuta la base per ulteriori aspirazioni all'indipendenza e allo sviluppo dell'identità panamense.